狭间世界·拉克里玛。这片土地是因女神为魔界·维斯佩尔与天界·艾克拉的争斗而叹息落泪所诞生的土地。 然而，夹在相互敌视的两个世界之间的拉克里玛，自诞生起便背负着始终受魔界侵略威胁的宿命。
为从这一威胁中守护此地而被赋予能力的，是魔法师与魔女们。他们毫无保留地发挥其能力，以为拉克里玛的人们提供守护为使命而战斗。
其中，驱使使魔、引出精灵之力的元素链接者的能力尤受重视。 但拥有成为元素链接者才能的人很少，而且使魔本身也难有诞生之宿命――。 因此，与魔界之间压倒性的力量差距无法填补，拉克里玛眼看就要被那股威胁的浪潮吞没。
拯救了这一局面的，是率领大使魔林克斯的传说精灵使“格兰德·林克斯”。
就这样，世界重归和平，转眼已数百年……。传说早已成为过去，各地依地方与民族分为若干国家，自治不断推进。 然而，唯独魔法依旧维持着一极支配。因此，魔法省静静地、却确实地走上了腐败之路。 当然，隶属于那里的魔法师们的意识也同样一点点却确实地发生变质。奉献精神变为特权意识―― 本应与民众分享的魔法恩惠则转向维护既得利益的方向――。
在这样的局势中，一位年轻魔法师·赫利奥多尔出于“魔法并非只应由一部分特权阶级保有”的意识，提出了让没有魔力者也能使用魔法的“炼金术”这一构想。这一思想转眼间便得到没有魔力的民众支持，不仅如此，同为魔法师的人中也出现了许多赞同该思想者。 然而，在这一理念被热烈讨论之际，其提倡者赫利奥多尔的身影却从拉克里玛忽然消失。 有人说是对此动向深感不快的中央魔法省所为，也有人说是见不得拉克里玛文明水平提升的魔界所为，各种猜测流传，但真相仍隐于黑暗之中――。 然而，正因为发生了那起事件，反而使炼金术这一思想被广泛传播给人们，这虽是讽刺，却是确凿的事实。
那起事件十余年后―― 在炼金术理念开始转向实践的今天。作为魔法教育机构中名门中的名门，“克罗伊泽伦格魔法学院”终于新设炼金科。 更名为克罗伊泽伦格魔“术”学院，并大幅转向广泛解放魔法这一恩惠的方向。 对中央魔法省而言，这是令人惊愕的事实。甚至有人觉得自己母校仿佛将刀刃指向了自己，还有传闻称其暗中运作，试图阻止炼金术科成立。
而如今，一位暗藏炼金术才能的年轻人，正投身于这一漩涡之中。 这是天的安排，抑或是血的指引―――
他并未察觉，仿佛受他引导一般，巨大的力量也正要觉醒……。
