主人公・泉户裕理是八衢神社的独生子。 喜欢摆弄摩托车和汽车，考虑将来从事一级维修师或设计开发的工作，但 对老家神社的事也感到迷茫，还没有成为明确的目标。 尽管对未定的将来抱有模糊的不安，仍与朋友河合亚美莉和要三九郎等人一起， 在创圣学院讴歌着学院生活。
就在他升入最高年级的春假期间。 学院进行操场扩建工程时，挖出了奇妙的遗迹。 偶然在场的裕理独自一人，从完全不同的方向对遗迹产生了兴趣。 因为上面刻着只在老家神社才见过的一种奇特纹样。
八衢神社流传着一位被称为「たゆたゆ大人」的神明的传说。 那是周边一带的守护神，但据说若怠慢对待，就会带来非同寻常的灾祸。 出土的遗迹上也雕刻着可读作「太转依（たゆたい）」的文字。 甚至还在遗迹一带发现了四处飞舞的极小极小的物怪。
裕理、亚美莉、三九郎， 虽然担心若对出土遗迹处理不当会酿成大祸， 但就连身为神主的父亲也斥之为迷信，班主任老师和学院理事等人也不予理会。
不久，对遗迹进行科学鉴定后，得出了「学术上毫无价值」的结果。 是破坏还是迁移，结论仍留有探讨余地，但 总之工程决定继续推进。 在新学期开始前完成操场扩建工程的日程安排没有改变。
对此感到危机的裕理，夜里与亚美莉和三九郎一起悄悄潜入学院， 打算进行御魂移迁。就算遗迹被破坏或怎样， 也不能对栖息其中的神明失礼——这很像神社独生子的裕理想法。
然而，这个仪式竟然真的引出了看似神明的东西。 那东西高贵端庄，甚至让人感到威严，用古旧的语调向裕理滔滔不绝地说了起来。 讲述被封在这片土地上的、名为太转依（たゆたい）的物怪们的故事——。
然后迎来了开学典礼当天。 关于那晚潜入学校的事， 一边被フローレス的学生会长・如月美冬追究， 裕理一边在意着昨晚不可思议的事情。 就在这时，一个同龄女孩出现在他面前。 面对困惑的裕理，她突然脱口而出——。
「来吧，实现跨越五百年之梦的时刻到了！ 让我们夫妇俩开辟一个人与太转依能够共存的新世界吧！」
随着她「真白」的登场，裕理的学园生活风云突变。 青梅竹马的亚美莉嫉妒得闹别扭耍脾气，三九郎帮不上任何忙。 本该像妹妹一样长大的由美奈，误解了真白与他的关系而讨厌他， 美冬则投来满是猜疑的目光，追着他到处跑。
而当事人真白则不看气氛地一直黏着他。 她究竟是何方神圣？ 太转依到底是什么？ 泉户裕理的明天会怎样！
