远离人烟的深山、深林尽头的鬼方村。 那里本该是被时代洪流抛弃、如今已空无一人的废村。 父母早亡，与妹妹由水(ゆみ)相依为命的善良青年，鬼方纯一(おにかたじゅんいち)。 夏日的一天，他发现了一封20年前在鬼方村杳无音信的祖父写给家人的最后遗书。
——我发现了不该发现的东西。
纯一对那封信感到一种奇妙的吸引力，一边安抚担心的由水，一边决定独自前往鬼方村。 在前往已成为废村的鬼方村的途中，纯一得知，曾经不仅是祖父，村里的男人们也一同失踪了。 20年前，村里究竟发生了什么。
然后，纯一做了一个悲伤的梦。 “再见” 少女这样说着，走向了永远的离别。 梦中，纯一呼唤着那个素未谋面的少女的名字。 菖蒲(あやめ)——。
穿过喧嚣的深林，抵达的鬼方村。 那里毫无疑问是一个完全脱离了人类支配、腐朽不堪的孤独世界。 那天夜里，借宿在祖父宅邸的纯一，又一次梦见了同一个少女。 梦中，少女正被侵犯。 身穿漆黑的嫁衣，美丽的脸庞因痛苦而扭曲，却仍拼命想要对呼唤“菖蒲”的声音微笑。 离奇而淫靡的梦。 醒来的纯一，发现自己身处一个毫无印象的地方。 身旁躺着一个诡异的木箱。 纯一出于好奇，打开了盖子。 里面装的，是与梦中分别、梦中侵犯的少女一模一样的——人偶。
然后，一个与那个人偶一模一样、自称菖蒲的少女出现在纯一面前。 在空无一人的村庄里，两人逐渐被彼此吸引。 菖蒲究竟是什么人。 逐渐明朗的，鬼方村隐藏的秘密是什么。 逼近纯一与菖蒲的悲伤命运是什么。 然后，当一切真相大白时，纯一选择的答案是——。
