魔法正逐渐得到认知的混乱过渡期——。 世界上因魔力引发的被称为「魔法灾害」的灾祸频繁发生， 人们至今仍对魔法抱有避讳之感。 是否接纳魔法这一未知存在，卷入政治的争论看不到终点， 掌握权力的人们为了自己的欲望在暗处策划阴谋。 在这样的情况下，以魔力为武器战斗的少女们开始被人们纷纷谈论。 将看似阴暗之影的魔法存在，试图转变为照亮和平之光的光辉女神们。 魔法战士——不知是谁先如此称呼，她们已以此名广为人知。 在这个国家首次将魔法纳入课程的学园——国际教导学园就读的一名女学生，御白晴香。 在学园学习炼金术的她，是守护人们免受魔之威胁的魔法战士，エメロードフィーネ。 身为炼金术研究者的父亲留下的エメロードラピス。 借助那份力量变身的晴香，在国际教导学园教师立花亚梨子、镜岛树的引导下， 作为新的魔法战士之一投身战斗。 与同样就读于国际教导学园的魔法战士イクシードナイツ协力， 守护人们免受魔法灾害的日常。 某一天，转校生黑宇霞出现在晴香面前。 以那次相遇为契机，晴香与霞，两人的命运开始大幅转动——。
