乃木坂翔是就读于私立朱鹭坂学园的、极其平凡的学生。 这样的他明明是星期天，却和妹妹咲姬一起前往学园，是有原因的。 那是因为他听说，为了凑人数而加入的超自然现象研究会的会长、同时也是青梅竹马的泉岳寺摩耶，将要举行某个魔术仪式。
与同为超研成员且是咲姬挚友的赤羽明梦美汇合后，咲姬她们便结伴走掉了。 在翔无奈地想要追上去时，隶属于报道部的前辈虎之门京子(虎ノ門京子)挡住了他的去路。 就在他打算和气势汹汹地说着今天一定要让她采访的京子一起，前往作为社团活动室的图书室时。 突然发生了地震，在震耳欲聋的轰鸣声中，翔他们失去了意识。
不知过了多长时间。恢复意识的翔所看到的，是仿佛没有发生过地震般寂静的、熟悉的走廊。 然而，他们将会发现。 在校门的另一边，沙漠一直延伸到地平线的尽头……
