秘密联合地球防卫部队。抵御任何胆敢威胁人类和平与神圣性的外星存在的第一道也是最后一道防线。凭借最新尖端的秘密武器和人类所能提供的最勇敢、最强壮的士兵，所有带着虚假友谊与和谐之辞前来的外星人，都已被光荣的秘密联合地球防卫部队英勇消灭。直到今天。
为了追逐一头难以想象的凶猛残暴的魔兽穿越时空，为银河系带来正义与自由者中最伟大的存在——究极魔法少女玛娜娜——抵达地球，毫不畏惧秘密联合地球防卫部队的全部军力。在这里，她遇见了普通的日本少年俊一，一个年轻胆怯的男孩；当那头魔兽降落时，他被压得血肉模糊，鲜红的血液和内脏溅洒在道路上，碎裂的骨片成了这个曾经明亮鲜活的年轻人仅存的坚实遗骸。
但秘密联合地球防卫部队作为人类所知的最强军事力量而令全球畏惧，并非没有原因。他们不会如此轻易受挫，于是集结人类各军联合的全部力量，摧毁任何胆敢反抗其权威者，并升起旗帜、启动他们的巨型死亡机器人，准备将这些肮脏的外星渣滓彻底消灭。他们的兵力足以压倒玛娜娜的全部魔力吗？那头魔兽会给城市带来死亡与毁灭吗？俊一最终会向他唯一的真爱——性格外向的假小子安娜——告白吗？只有时间能给出答案。
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