近未来、人類は「プロメテウス細胞計画」を始動させた。遺伝子編集と人工知能を融合させ、人体強化と文明の進化を目指す壮大な計画である。 しかし実験は完全に制御を失い、未知の「崩壊因子」が実験サンプルから流出した。この因子は有機細胞や電子機器を侵食し、生物の変異や機械の暴走を引き起こし、ついに「大崩壊」を誘発した。 都市は荒廃し、自然は歪み、科学技術は機能停止。人類は絶滅寸前にまで追い込まれた。 唯一生き残った「星核」AI 指揮台は、当時の実験基地が遺した人工知能であり、一部の実験データと崩壊後の世界情報を保管している。微弱な電波で生存者であるプレイヤーと接触し、崩壊の根源を探し出し、災厄を覆す道を探すよう誘導する。 プレイヤーは改造人間の最後の生き残りであり、体内に崩壊因子耐性因子が埋め込まれている。崩壊濃度の高い環境でも正常に行動でき、唯一災厄の拡大を食い止める可能性を持つ存在だ。
